Los mejores software de contabilidad para autónomos y pymes en 2026

Holded, Quipu, Contasimple, Sage 50 y Anfix comparados con criterios reales: facilidad para emitir facturas electrónicas, presentación de modelos tributarios, integración bancaria y coste total. Sin comisiones que distorsionen nuestra opinión.

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Software de contabilidad para autónomos y pymes: comparativa completa

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Factura electrónica B2B y programas de facturación: dos obligaciones distintas

El Real Decreto 238/2026 regula la factura electrónica en operaciones entre empresarios y profesionales: cuando quien debe emitir factura realiza una operación cuyo destinatario es otro empresario o profesional con sede, establecimiento permanente o domicilio en España. El propio decreto prevé excepciones, entre ellas determinadas facturas simplificadas. No establece una obligación general de factura electrónica para las ventas a consumidores. Consulta el Real Decreto 238/2026 en el BOE y su ámbito de aplicación en los artículos 3 y 4.

Los plazos de aplicación efectiva se cuentan desde la entrada en vigor de la Orden HAC/1028/2026, que entró en vigor el 6 de octubre de 2026. El plazo es de 12 meses para empresarios y profesionales cuyo volumen de operaciones superó 8 millones de euros durante el año natural anterior, y de 24 meses para el resto. Por tanto, la aplicación comienza el 6 de octubre de 2027 para el primer grupo y el 6 de octubre de 2028 para el resto; no había empresas obligadas por este calendario desde 2025 ni se trata de una implantación general en 2026-2027. La Orden HAC/1028/2026 en el BOE inicia el cómputo. El sistema puede utilizar plataformas privadas interoperables, la solución pública o ambas; el RD no convierte FacturaE en el único formato universal.

Por separado, el Real Decreto 1007/2023 establece requisitos para los sistemas y programas informáticos que soportan procesos de facturación (integridad, conservación y trazabilidad de los registros). Para los obligados tributarios del artículo 3.1.a, los sistemas deben estar adaptados antes del 1 de enero de 2027; para el resto de los obligados incluidos en el artículo 3.1, antes del 1 de julio de 2027. El texto consolidado recoge estas fechas en su disposición final cuarta: Real Decreto 1007/2023 en el BOE. Este calendario de adaptación del programa es distinto de la obligación B2B de emitir y recibir factura electrónica, y no equivale a afirmar que todo contribuyente deba remitir sus facturas a la AEAT mediante Veri*Factu.

En consecuencia, conviene preguntar al proveedor qué requisitos cubre su producto, en qué fecha estará adaptado y si permite operar con las vías y formatos aplicables a la factura electrónica B2B. Las normas citadas no certifican por sí mismas la adaptación de los programas incluidos en esta comparativa.

⚠️ Comprueba qué obligación se aplica a tu caso

La factura electrónica B2B y los requisitos de los sistemas informáticos de facturación son regímenes diferentes, con ámbitos y plazos propios. No se puede concluir solo por usar Excel o Word que exista una infracción: depende de si estás dentro del ámbito de cada norma y de cómo expidas tus facturas. Verifica con un asesor o con la AEAT qué sistema necesitas y solicita al proveedor información verificable sobre su adaptación.

Tabla comparativa de los mejores software de contabilidad en 2026

SoftwarePrecio/mesFactura electrónicaModelos AEATBancoMejor para
🥇 Holded ~49 € Sí Completo Sí Pymes y agencias
Quipu ~19 € Sí Sí Sí Autónomos
Contasimple ~9 € Sí Básico Limitado Autónomos bajo volumen
Sage 50 ~35 € Sí Completo + SII Sí Pymes con gestoría
Anfix ~29 € Sí Completo Sí Pymes con empleados

🥇 Holded — El ERP todo-en-uno más completo para pymes

⭐ Mejor todo-en-uno
🏢
Holded
ERP cloud español · Facturación + Contabilidad + CRM + Inventario + RRHH
desde 49 €/mes Prueba gratuita 14 días
🧾 Facturación
📊 Contabilidad
👥 CRM
📦 Inventario
👷 RRHH
🏦 Banca
📋 Modelos AEAT
📄 FacturaE
Basic~14€/mes — Solo facturación
Standard ★~49€/mes — Todo incluido
Advanced~99€/mes — Multi-empresa
Holded es la respuesta española a los grandes ERP internacionales: un software en la nube que integra en una sola plataforma la facturación, la contabilidad real (doble entrada, asientos automáticos), el CRM para gestionar clientes y oportunidades, el inventario, los proyectos y la gestión de RRHH con nóminas. Para pymes de entre 5 y 50 empleados que quieren evitar tener 5 herramientas separadas, Holded es la opción más coherente. La integración bancaria automática concilia movimientos bancarios con facturas sin intervención manual. Genera automáticamente los modelos 303, 130, 111, 190, 340 y 347 listos para presentar en la AEAT.
Puntos fuertes
  • El único que integra ERP completo + contabilidad real
  • Conciliación bancaria automática
  • Todos los modelos AEAT generados automáticamente
  • FacturaE y SII incluidos
  • App móvil excelente para gestión en movimiento
  • Empresa española — soporte en castellano nativo
Puntos débiles
  • El más caro de la comparativa para funciones completas
  • Excesivo para autónomos con facturación baja
  • Curva de aprendizaje mayor que Quipu o Contasimple

📱 Quipu — El más sencillo y completo para autónomos

🧾
Quipu
Facturación y contabilidad para autónomos · Conectado con gestoría · IA para gastos
desde 19 €/mes 15 días gratis sin tarjeta
🧾Facturación
📊Contabilidad
👥CRM
📦Inventario
📸Scan tickets
🏦Banca
📋Modelos AEAT
📄FacturaE
Autónomo~19€/mes — Facturación básica
Profesional ★~29€/mes — Contabilidad + banco
Empresa~49€/mes — Multi-usuario
Quipu es el software favorito de los autónomos españoles que quieren algo más que un simple facturador pero menos complejo que un ERP completo. Su función estrella es el escaneo de tickets y facturas con reconocimiento automático: fotografías un ticket de gasolina o una factura de proveedor con el móvil y Quipu extrae automáticamente el NIF, el importe y el IVA. La conexión con tu gestoría facilita enormemente el trabajo compartido: tu gestor accede directamente a tus datos y prepara los modelos tributarios sin que tengas que exportar y enviar archivos. Compatible con factura electrónica FacturaE.
Puntos fuertes
  • Escaneo de tickets con IA — automatiza la entrada de gastos
  • Diseñado específicamente para autónomos españoles
  • Colaboración con gestoría muy bien implementada
  • App móvil excelente para registrar gastos en el momento
  • Soporte en español con conocimiento fiscal local
Puntos débiles
  • Sin CRM ni gestión de proyectos
  • Precio algo alto para autónomos con pocos movimientos
  • Informes financieros más limitados que Holded

💰 Contasimple — El más económico y sencillo para empezar

📝
Contasimple
Facturación y gastos para autónomos · Plan gratuito disponible · Muy sencillo
desde 0 €/mes Plan de pago desde ~9€/mes
🧾Facturación
📊Contabilidad
👥CRM
📦Inventario
📸Scan tickets
🏦Banca
📋Modelos AEAT
📄FacturaE
Gratis3 facturas/mes, 3 gastos/mes
Básico~9€/mes — 30 facturas, sin gestoría
Profesional ★~19€/mes — ilimitado + gestoría
Contasimple es la opción más accesible para autónomos que acaban de empezar o tienen un volumen de facturación muy bajo. Su plan gratuito (con limitaciones) permite probar el servicio sin compromiso. La interfaz es la más sencilla de todas las analizadas: crear una factura lleva menos de 2 minutos. Compatible con factura electrónica. Su mayor limitación es que no tiene una contabilidad real de doble entrada: registras ingresos y gastos, y el sistema calcula el IVA e IRPF, pero no genera el Plan General Contable completo que exigen algunas sociedades.
Puntos fuertes
  • Plan gratuito real — ideal para probar
  • La interfaz más sencilla del mercado
  • Precio muy competitivo en planes de pago
  • Suficiente para autónomos con facturación baja
  • Soporte en español
Puntos débiles
  • Sin contabilidad real de doble entrada
  • Integración bancaria limitada en planes básicos
  • No válido para sociedades con obligación de contabilidad completa

🏛️ Sage 50 — El estándar de las gestorías profesionales

📊
Sage 50
Contabilidad profesional · SII automático · Integración gestoría · Plan General Contable
desde 35 €/mes 30 días de prueba gratuita
🧾Facturación
📊Contabilidad
👥CRM
📦Almacén
👷Nóminas
🏦Banca
📋SII + Modelos
📄FacturaE
Sage 50 Esencial~35€/mes — Contabilidad básica
Sage 50 Extra ★~55€/mes — + Nóminas y almacén
Sage 50 Total~75€/mes — Completo multi-empresa
Sage 50 es el programa de contabilidad que usan la mayoría de gestorías y despachos profesionales en España. Si trabajas con un gestor externo, hay muchas probabilidades de que él ya use Sage y la compatibilidad directa de archivos te ahorrar horas de trabajo. Es el software con la contabilidad más completa y rigurosa de esta comparativa: Plan General Contable completo, gestión de SII en tiempo real para empresas obligadas, cálculo automático de todos los modelos AEAT, nóminas integradas y gestión de almacén. La curva de aprendizaje es mayor, pero para pymes con necesidades contables serias, es el más potente.
Puntos fuertes
  • Contabilidad más completa y rigurosa del mercado
  • SII automático incluido
  • Estándar de las gestorías — compatibilidad máxima
  • Nóminas y RRHH integrados
  • El más recomendado por asesores fiscales
Puntos débiles
  • La interfaz más antigua y menos intuitiva
  • Precio elevado para autónomos simples
  • Curva de aprendizaje significativa

👷 Anfix — El mejor para pymes con empleados y nóminas

🏭
Anfix
Gestión integral pyme · Nóminas + Facturación + Contabilidad · Fabricado en España
desde 29 €/mes 15 días gratis
🧾Facturación
📊Contabilidad
👥CRM
👷Nóminas
🏦Banca
📋Modelos AEAT
📄FacturaE
📦Almacén
Básico~29€/mes — Facturación + contabilidad
Profesional ★~49€/mes — + Nóminas hasta 5 empleados
Empresa~79€/mes — Empleados ilimitados
Anfix destaca como la opción más equilibrada para pequeñas empresas con empleados que necesitan facturación, contabilidad y nóminas integradas sin el coste y la complejidad de Sage. La gestión de nóminas de Anfix es especialmente potente: calcula automáticamente las cotizaciones a la Seguridad Social, genera los TC1 y TC2 listos para presentar y mantiene el historial de empleados. La integración bancaria con más de 30 entidades financieras españolas automatiza la conciliación de movimientos. Es la alternativa más moderna y user-friendly a Sage para pymes de 2-20 empleados.
Puntos fuertes
  • El mejor para pymes con empleados (nóminas integradas)
  • Interfaz moderna y más intuitiva que Sage
  • Integración bancaria con 30+ entidades españolas
  • Empresa española — soporte fiscal local
  • Precio razonable para lo que incluye
Puntos débiles
  • Menos conocido — menor ecosistema de gestorías compatibles
  • Sin CRM completo
  • Informes menos detallados que Holded

¿Cuál elegir según tu situación?

🆕 Autónomo que empieza
Pocas facturas al mes, no tienes empleados, quieres algo sencillo y barato para cumplir con Hacienda.
🏆 Contasimple (gratis o ~9€/mes) — lo más sencillo para empezar.
👨‍💼 Autónomo consolidado
Varias facturas mensuales, gastos frecuentes, quieres automatizar y colaborar fácilmente con tu gestor.
🏆 Quipu Profesional (~29€/mes) — escaneo de tickets + gestoría integrada.
🏢 Pyme con equipo (sin empleados)
Empresa pequeña con varios usuarios, clientes, proyectos y necesidades de contabilidad real.
🏆 Holded Standard (~49€/mes) — ERP completo en una sola herramienta.
👷 Pyme con empleados
Empresa con 2-20 empleados que necesita gestionar nóminas, SS y contabilidad integrados.
🏆 Anfix Profesional (~49€/mes) o Sage 50 Extra si ya trabajas con gestoría.
🏛️ Ya trabajo con gestoría externa
Tu gestor lleva la contabilidad pero necesitas una herramienta compatible con la suya.
🏆 Pregunta a tu gestor qué usa — si usa Sage, esa será siempre la opción más compatible.
⚡ Empresa obligada al SII
Facturación superior a 6 millones de euros anuales, obligada al Sistema de Información Inmediata.
🏆 Sage 50 Total o Holded Advanced — ambos gestionan el SII automáticamente.
💡 Consejo final antes de decidir

Todos los software de esta comparativa ofrecen período de prueba gratuito (15-30 días). Prueba el que más te interese con datos reales antes de comprometerte. El criterio más importante que la mayoría ignora: ¿lo usarás realmente? El mejor software de contabilidad es el que efectivamente abres cada semana para registrar facturas y gastos, no el que tiene más funciones en papel.

Preguntas frecuentes sobre software de contabilidad

¿Qué programa de contabilidad es mejor para autónomos en España en 2026?
Para autónomos que empiezan: Contasimple (gratis o ~9€/mes). Para autónomos con mayor volumen y gestor: Quipu (~19-29€/mes). Para autónomos que quieren todo integrado (CRM, inventario, proyectos): Holded (~49€/mes). Para autónomos cuya gestoría ya usa Sage: Sage 50 Esencial (~35€/mes).
¿Es obligatoria la factura electrónica para autónomos en 2026?
No: la obligación específica del Real Decreto 238/2026 no empieza en 2026. Sus plazos empiezan con la entrada en vigor de la Orden HAC/1028/2026, el 6 de octubre de 2026. Se aplican a los 12 meses para quienes superaron 8 millones de euros de volumen de operaciones el año natural anterior y a los 24 meses para el resto (desde el 6 de octubre de 2027 y el 6 de octubre de 2028, respectivamente), en las operaciones B2B comprendidas en la norma y con sus excepciones. Es distinto de la adaptación de los sistemas informáticos de facturación, cuyo calendario general fija el RD 1007/2023 antes del 1 de enero de 2027 para los obligados del artículo 3.1.a y antes del 1 de julio de 2027 para el resto incluido en su artículo 3.1. La adaptación concreta de cada programa debe confirmarse con su proveedor. RD 238/2026 · Orden HAC/1028/2026 · RD 1007/2023.
¿Necesito un gestor si uso un software de contabilidad?
No es obligatorio para las tareas básicas, pero la mayoría de autónomos siguen trabajando con gestor para la presentación de modelos tributarios (303, 130, 111, 190) y la declaración de la renta. Los software modernos facilitan la colaboración con tu gestor exportando datos en los formatos que necesitan. Para sociedades, la contabilidad completa suele requerir un contable o gestor.
¿Qué diferencia hay entre un programa de facturación y uno de contabilidad?
Un programa de facturación solo te permite emitir facturas y registrar gastos para calcular IVA e IRPF. Un programa de contabilidad real incluye además el Plan General Contable, asientos contables de doble entrada, balance de situación y cuenta de resultados. Para autónomos en estimación directa simplificada, la facturación puede ser suficiente. Para sociedades o autónomos en estimación directa normal, se necesita contabilidad completa.
¿Cuánto puede ahorrar un autónomo con un buen software de contabilidad?
El ahorro va por dos vías. Tiempo: un autónomo sin software dedica entre 2 y 5 horas mensuales a tareas administrativas manuales que se reducen a 30-60 minutos con un buen software. Dinero: muchos autónomos pagan más IVA del necesario por no registrar correctamente todos los gastos deducibles. Un software que facilita el registro de gastos con escaneo de tickets puede recuperar cientos de euros anuales en deducciones.

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Equipo Cultura Tecno

Software · Gestión empresarial · Fiscalidad

Esta comparativa ha sido elaborada con la colaboración de asesores fiscales colegiados y autónomos que usan estos programas en su día a día. Los precios son orientativos de junio de 2026 y pueden variar. Consulta siempre con tu asesor fiscal para decisiones tributarias específicas.